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期刊论文
流形排序算法预测microRNA
王常武
刘兵强
王宝文
刘文远
· 2012
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阅读量:6
微小RNA
加权图
置信传播
流形排序
预测
生物信息学
期刊名称:
计算机应用研究 2012 年 03 期
摘要:
在已知microRNA(miRNA)较少的情况下,为了提高算法预测的准确性,提出一种基于流形排序的miR-NA预测算法。该算法采用加权图模型描述序列,使用置信传播分配排序分数,降低了算法的时间复杂度;算法根据大规模数据内部全局流形结构进行排序,提高了排序结果的准确性。在人类和按蚊全基因组范围内的实验证明,流形排序算法的预测效果优于传统的预测方法,可以作为预测miRNA的一个有效工具。
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