摘要：
生物地理学主要研究生物的多样性在不同的时间和空间上的分布,以及它们在不同分布带的多样性差异和丰富度差异。本研究通过新疆盐湖和云南拟诺卡氏属(Nocardiopsis)菌株遗传进化差异来阐述拟诺卡属(Nocardiopsis)菌株地理分布的特征。首先通过从新疆艾丁湖、七角井、罗布泊的盐湖,云南黑井盐矿、江城盐矿、云龙诺邓千年古盐井、洱源乔后盐矿的土样中筛选70株拟诺卡氏属(Nocardiopsis)菌株。其次通过DNA-DNA序列相似性和16S rRNA基因序列相似性相关性来进一步确定拟诺卡氏属(Nocardiopsis)菌株之间的亲缘关系,以16S rRNA基因相似性将70株拟诺卡氏属(Nocardiopsis)菌株划分为7个OTUs(Operational Taxon Unite),使用每个OTU中的典型菌株命名该类群。其中有一个OTU的分类地位暂不明确,可能是一个潜在新物种,所以将其命名为NEW。以下便是7个OTUs:Nocardiopsis terra,Nocardiopsis xinjiangensis,NEW,Nocardiopsis aegyptia,Nocardiopsis lucentensis,Nocardiopsis alba,Nocardiopsis kunsanensis,Nocardiopsis metallicusmei。再次通过gyrB,rpoB,sodA三个看家基因的串联分析研究拟诺卡氏属(Nocardiopsis)菌株7个类群在不同盐环境的地理区域分布特征。根据结果,发现只有3个OTUs(Nocardiopsis terrae,Nocardiopsis xinjiangensis,NEW)在gyrB基因分析中有较弱的地域分布特征,3个OTUs(Nocardiopsis terrae,Nocardiopsis xinjiangensis,NEW)在rpoB基因中有较为明显的地域分布特征,4个OTUs(Nocardiopsis terrae,Nocardiopsis xinjiangensis,NEW,Nocardiopsis aegyptia)在sod A基因中有较为明显的地域分布特征。而在三个基因串联分析中7OTUs都有较为明显的地域分布特征。因此推测三个基因受到的环境选择压有差异,所以拟诺卡氏属(Nocardiopsis)菌株在三个基因的遗传进化上形成的地理分布也有很大差异。最后通过本实验室前期工作基础,对采样点土壤的理化组成成分进行了CCA分析,初步探讨形成拟诺卡氏属(Nocardiopsis)菌株生物地理学的原因。并根据结果,发现三个环境理化参数(Na+,K+,pH)对形成拟诺卡氏属(Nocardiopsis)菌株地理分布有明显的影响作用。
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