HIV-1 CRF01_AE亚型在东南亚的系统地理学研究
彭晓荣 吴南屏 · 2016
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会议名称:
浙江省免疫学会第十次学术大会
会议时间:
2016-08-05 00:00:01
会议地点:
中国浙江杭州
摘要:
目的:CRF01_AE已成为东南亚最主要的HⅣ-1流行性重组株(CRF),主要包括中国和泰国。然而,到目前为止,对东南亚的CRF01_AE时空分布规律尚未进行详细的探讨。方法:本研究所有的CRF01_AE的POL片段都是从Los Alamos HIV数据库中获得的。我们对其中的138个POL片段进行了系统发育分析。这个分析主要利用贝叶斯-马氏链蒙特卡罗方法(Bayesian-MCMC),使用的软件为BEAST。我们还用贝叶斯时间离散系统地理方法评估了病毒的时空迁移史。结果:重建的结果显示中非共和国的根状态后验概率(0.935)最高。病毒于1981年4月从中非共和国迁移到泰国(95%最大后验密度[1978年5月-1983年9月])。在接下来的几年里,该亚型病毒的感染人数在泰国迅速增长。而且泰国成为了CRF01_AE在东南亚的主要扩散中心。在90年代初,病毒开始在中国的云南、福建、辽宁出现。在1997年前后,这一亚型的病毒蔓延到中国的许多省份。其中广西和辽宁是其中主要的扩散中心。结论:本研究重点探索了CRF1_AE病毒在东南亚,特别是中国蔓延的时空规律。该研究加深了我们对HIV-1在东南亚流行规律和进化史的理解。
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