利用混合线性模型和BayesCPi进行QTL-MAS2011公共数据集的全基因组关联分析

朱波吴洋齐欣牛红张静静王延晖陈燕张路培高会江高雪李俊雅孙少华 · 2014

阅读量：60

QTL-MAS2011

期刊名称：

畜牧兽医学报 2014 年 05 期

摘要：

本研究利用MTDFREML对QTL-MAS2011公共数据集的模拟性状进行方差组分估计,遗传力估计约为0.29。主成分分析显示,群体内不存在显著的群体分层现象,然后用2种模型进行全基因组关联分析研究。利用GAPIT程序包中的混合线性模型对QTL-MAS2011公共数据进行全基因组关联分析,共得到10个显著的单核苷酸(SNP)位点(P<0.05),其中,4个显著的SNPs在1号染色体上,4个显著的SNPs在3号染色体上,2个显著的SNPs在5号染色体上。使用HAPLOVIEW软件对1~3号染色体上88...