社区获得性ST59型MRSA HZW450的全基因组测序及分析
倪淑君
郭丽华
周佳维
孟晓华
姚坚
吴灵娇
张琼
李兰娟
· 2017
期刊名称：
中国微生态学杂志
2017 年
12 期
摘要：
目的对1例脓疱疮患者脓液中分离的1株社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(CA-MRSA)HZW450菌株进行全基因组测序并对序列信息解析。方法使用三代测序PacBio技术对HZW450菌株进行全基因组测序,且使用SMRTanalysis v.R2.3.0对该序列进行序列拼接,上传NCBI进行基因功能注释,用RPSBLAST program进行直系同源簇(COG)注释以及毒力因子相关基因和耐药基因分析。同时比较国内其他地区发现的同一序列型(ST)的菌株毒力因子相关基因及耐药相关基因的差异,并比较HZW...
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