基于银耳转录组测序的多糖代谢途径分析
王东 牛蓓 宋君 赵树海 雷绍荣 郭灵安 张富丽 刘文娟 常丽娟 赵黎明 · 2019
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期刊名称:
西南农业学报   2019 年 第32卷 卷 第6期 期
摘要:
【目的】对银耳进行转录组测序分析,分析多糖生物合成途径和挖掘关键功能基因。【方法】采用Illumina Hiseq 2500测序平台对银耳菌丝体进行测序,组装得到unigene序列,并与公共数据库进行对比分析和注释,挖掘果糖和甘露糖代谢通路相关基因。【结果】本研究共得到4.72 Gb raw data,拼接后获得17 008条unigene序列,N50为2073 bp;注释结果表明,76.47%序列能够注释到Uniprot公共数据库,注释到GO分类和KEGG通路的unigene分别为10 152和5...
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