摘要：
为了研究硼参与鸵鸟免疫应答的作用机制,本研究采用RNA-Seq技术,首次对微量元素硼在鸵鸟胸腺免疫应答反应中的作用进行了高通量测序分析。本试验共选取3个样本进行转录组学分析,包括对照组鸵鸟胸腺,B80组鸵鸟胸腺,B640组鸵鸟胸腺。RNA-Seq分析结果显示:(1)3个鸵鸟胸腺测序文库(Control组样本文库,B80组样本文库和B640组样本文库)的Clean Data占reads总数的比例分别为98.61%,98.60%和98.68%。(2)三个文库中测序覆盖度达90-100%的基因数量占总数量的比例分别为72%,71%和69%。(3)Control组和B640组,B80组和B640组,Control组和B80组差异基因比较总计分别有2044个,1085个和902个差异基因。(4)本试验中所有的差异基因共分成了7种表达趋势,其中趋势0,趋势1和趋势3具有差异显著性。趋势0中共包含1290个差异基因,在3个文库中(Control,B80和B640)的表达依次呈现持续下降的趋势;趋势1中共包含1030个差异基因,在3个文库中的表达依次呈现先下降后保持不变的趋势;趋势3中共包含1487个差异基因,在3个文库中的表达依次呈现先上升或不变后下降的趋势。(5)差异基因KEGG信号通路富集分析结果显示:细胞因子-受体互作通路,癌症通路,钙离子信号通路,肌动蛋白细胞骨架调节通路和MAPK信号通路显著富集,这些信号通路主要参与机体的免疫应答及炎症应答过程;除上述信号通路之外,硼能够参与Toll样受体信号通路,B细胞受体通路,T细胞受体通路和凋亡通路的调节。硼对鸵鸟机体的炎症及免疫机能调节的相关信号通路,主要包括MAPK信号通路,钙离子通路,B细胞受体通路,T细胞受体通路,肌动蛋白调节信号通路,Toll样受体信号通路,凋亡信号通路及癌症信号通路。
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